张竹青 教授 博士 研究领域: 新材料,石油炼制,石油化工,精细化工,生物医药 研究方向: 生物大分子的理论计算 所在单位: 中国科学院大学

基本信息

所在单位:
中国科学院大学
单位类型:
高等院校
职称:
教授
最高学历:
博士
教育经历:
1995.9-2000.7 北京化工大学 材料科学与工程学院 工学学士
2000.9-2005.7 中国科学院化学研究所 高分子物理与化学实验室 理学博士
工作经历:
2005.7-2007.11 北京大学 化学与分子工程学院,理论生物中心,博士后
2008.1-2011.5 加拿大多伦多大学 医学院生物化学系,博士后
2011.6-现在 中国科学院大学 生命科学学院,副教授、教授
专家介绍:
主要基于生物大分子的物理化学性质,通过理论与计算机模拟手段, 研究蛋白质聚集、折叠及别构机制,以及无序蛋白质的系综表征及翻译后修饰对结构及功能的影响。近年来在生物大分子液-液相分离方面进行了数据库的构建、预测及形成机制的理论及模拟研究。研究成果发表在Proc Natl Acad Sci U S A、Phys Chem Chem Phys、Bioinformatics及Nucleic Acids Res等期刊。

科研能力

研究领域:
新材料,石油炼制,石油化工,精细化工,生物医药
研究方向:
生物大分子的理论计算
中文标签:
蛋白质全新设计;蛋白质折叠;折叠动力学特征;目标结构
英文标签:
Desolvation;Folding Intermediate;S6;Chevron Plot;TOP7;Protein Folding;Machine Learning;Protein;Predictor;Phase Separation Proteins (psps)
论文著作:
1. Cooperativity, Local-Nonlocal Coupling, and Nonnative Interactions: Principles of Protein Folding from Coarse-Grained Models
Hue Sun Chan; Zhuqing Zhang; Stefan Wallin; Zhirong Liu
Annual review of physical chemistry, 2011

2. LLPSDB: a Database of Proteins Undergoing Liquid–liquid Phase Separation in Vitro
Qian Li; Xiaojun Peng; Yuanqing Li; Wenqin Tang; Jia'an Zhu; Jing Huang; Yifei Qi; Zhuqing Zhang
Nucleic Acids Research, 2019

3. Identification of Amyloid Fibril-Forming Segments Based on Structure and Residue-Based Statistical Potential
Zhuqing Zhang; Hao Chen; Luhua Lai
Bioinformatics, 2007

4. Prediction of Liquid-Liquid Phase Separation Proteins Using Machine Learning
Chu Xiaoquan; Sun Tanlin; Li Qian; Xu Youjun; Zhang Zhuqing; Lai Luhua; Pei Jianfeng
BMC Bioinformatics, 2022

5. Competition Between Native Topology and Nonnative Interactions in Simple and Complex Folding Kinetics of Natural and Designed Proteins
Zhuqing Zhang; Hue Sun Chan
Proceedings of the National Academy of Sciences, 2010

6. Molecular Dynamics Simulations on the Oligomer-Formation Process of the GNNQQNY Peptide from Yeast Prion Protein Sup35.
Zhuqing Zhang; Hao Chen; Hongjun Bai; Luhua Lai
Biophysical Journal, 2007

7. Kinetic Consequences of Native State Optimization of Surface‐exposed Electrostatic Interactions in the Fyn SH3 Domain
Arash Zarrine-Afsar; Zhuqing Zhang; Katrina L. Schweiker; George I. Makhatadze; Alan R. Davidson; Hue Sun Chan
Proteins Structure Function and Bioinformatics, 2011

8. Transition Paths, Diffusive Processes, and Preequilibria of Protein Folding
Zhuqing Zhang; Hue Sun Chan
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2012

9. Native Topology of the Designed Protein Top7 is Not Conducive to Cooperative Folding
Zhuqing Zhang; Hue Sun Chan
BIOPHYSICAL JOURNAL, 2009

10. LLPSDB V2.0: an Updated Database of Proteins Undergoing Liquid–liquid Phase Separation in Vitro
Xi Wang; Xiang Zhou; Qinglin Yan; Shaofeng Liao; Wenqin Tang; Peiyu Xu; Yangzhenyu Gao; Qian Li; Zhihui Dou; Weishan Yang; Beifang Huang; Jinhong Li; Zhuqing Zhang
BIOINFORMATICS, 2022
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