王初 教授 博士 北京市 研究领域: 研究方向: 化学生物学,蛋白质组学,计算生物学 所在单位: 北京大学

基本信息

所在单位:
北京大学
机构细分:
化学化工学院
单位类型:
高等院校
职务:
教授
职称:
教授
最高学历:
博士
教育经历:
1996.09—2001.08   中国科学技术大学生命科学学院 本科学生
2001.09—2007.06   美国西雅图华盛顿大学生物化学系 博士研究生
专家介绍:
王教授在博士和博士后期间分别师从美国科学院院士David Baker和Benjamin F. Cravatt教授进行Rosetta蛋白质结构建模和设计以及Activity-based Protein Profiling (ABPP)活性蛋白质组分析方面的工作。自2013年12月开始在北京大学开展独立研究工作以来,其课题组致力于“化学和计算驱动的功能蛋白质组学”方法的开发和应用,综合运用化学生物学,现代高精度蛋白质质谱技术,生物化学,生物信息学以及计算结构生物学等诸多知识和技术,大规模发掘蛋白质组中被内源生物小分子或外源化学药物分子特异修饰的功能位点和靶点,并深入研究这些修饰对蛋白质的结构、功能以及其所在的细胞内新陈代谢和信号传导通路的影响, 从蛋白分子水平上解释多种病理条件的形成和诱因,为相关的药物和治疗手段的研发提供先期的理论基础。

科研能力

研究方向:
化学生物学,蛋白质组学,计算生物学
英文标签:
Proteomics;Chemoproteomics;General;Cell Biology;Biochemistry;Chemical Proteomics;Protein Structure Prediction;Protein Degradation;O-glcnacylation;Chemistry/food Science
研究成果:
发展高效的化学探针和定量质谱方法,实现活细胞内蛋白质翻译后修饰的精准探测,研究了它们参与细胞命运调控的生物学功能。
建立活性小分子靶标鉴定的组学方法,在复杂生物样品内发现天然产物、内源代谢物、外源药物的作用靶点,揭示它们的分子机制。
研发计算化学生物学方法,发掘全新的蛋白质活性中心、翻译后修饰和小分子结合位点,实现对蛋白质功能的精准调控。
发明专利:
1. 一种用于分离EVs的DSPE功能化琼脂糖介质及其制备方法和应用
北京大学; 北京大学成都前沿交叉生物技术研究院
王初; 张锦; 肖伟弟; 曾嘉明
公开日期: 2024-06-04 申请日期: 2024-01-08 公开号: CN118122293A

2. 一种快速高效的化学蛋白质组学样品制备方法
北京大学
王初; 肖伟弟; 陈颖; 张锦; 郭志昊
公开日期: 2023-06-27 申请日期: 2023-03-15 公开号: CN116337567A

3. 基于DIA的定量化学蛋白质组学筛选靶标的方法
北京大学
王初; 杨帆; 陈南
公开日期: 2022-11-25 申请日期: 2021-12-31 公开号: CN114354733B

4. 硫辛酰化修饰位点的定量化学蛋白质组学方法
北京大学
王初; 赖书畅; 陈颖; 杨帆; 肖伟弟
公开日期: 2022-08-30 申请日期: 2022-04-02 公开号: CN114966036A

5. 订书肽、其制备方法及其制药用途
北京大学
董甦伟; 王椠; 王初; 王朴疏; 王冯璋; 李瑞
公开日期: 2022-07-15 申请日期: 2022-03-17 公开号: CN114751962A

6. 基于DIA的定量化学蛋白质组学筛选靶标的方法
北京大学
王初; 杨帆; 陈南
公开日期: 2022-04-15 申请日期: 2021-12-31 公开号: CN114354733A

7. ACTIVATOR FOR SIMULTANEOUSLY ACTIVATING OXIDATIVE PHOSPHORYLATION AND INHIBITING GLYCOLYSIS AND USE THEREOF
LANZHOU UNIVERSITY
Jianye DAI; Chu WANG; Ning QIAO
公开日期: 2021-10-07 申请日期: 2020-06-28 公开号: US20210308093A1

8. CYSTEINE-REACTIVE LIGAND DISCOVERY IN PROTEOMES
The Scripps Research Institute
Benjamin Cravatt; Chu Wang; Keriann Backus
公开日期: 2021-07-08 申请日期: 2020-09-15 公开号: US20210208141A1

9. Cysteine-reactive ligand discovery in proteomes
THE SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE
Benjamin Cravatt; Chu Wang; Keriann Backus
公开日期: 2020-09-22 申请日期: 2014-08-13 公开号: US10782295B2

10. 一种同时激活氧化磷酸化通路和抑制糖酵解途径的激活剂及其应用
兰州大学
戴建业; 王初; 乔宁
公开日期: 2019-08-13 申请日期: 2019-07-04 公开号: CN110115712A

11. Composition useful for color modification e.g. bleaching of textile, preferably denim comprises a peroxidase, a source of hydrogen peroxide, and a mediator.
WANG C; OSTERGAARD L H; CHUWANG; OESTERGAARD L H; ZHOU Y; KALUM L; HUANG W; 0STERGAARD L H; OslashSTERGAARD L H
公开日期: 2019-06-25 申请日期: 2012-09-07 公开号: VN10021124B

12. Composition useful for color modification e.g. bleaching of textile, preferably denim comprises a peroxidase, a source of hydrogen peroxide, and a mediator.
ZHOU Y; WANG C; KALUM L; OSTERGAARD L H; HUANG W; CHUWANG; 0STERGAARD L H; OESTERGAARD L H; OslashSTERGAARD L H
公开日期: 2019-06-14 申请日期: 2014-04-16 公开号: IN313992B

13. Composition useful for color modification e.g. bleaching of textile, preferably denim comprises a peroxidase, a source of hydrogen peroxide, and a mediator.
ZHOU Y; WANG C; KALUM L; OSTERGAARD L H; HUANG W; CHUWANG; 0STERGAARD L H; OESTERGAARD L H; OslashSTERGAARD L H
公开日期: 2019-03-06 申请日期: 2014-03-13 公开号: MX363042B

14. CYSTEINE-REACTIVE LIGAND DISCOVERY IN PROTEOMES
SCRIPPS RESEARCH INST
WANG CHU; CRAVATT BENJAMIN; BACKUS KERIANN
公开日期: 2017-07-05 申请日期: 2014-08-13 公开号: EP3033625A4

15. Color modification of textile
ZHOU YUCHENG; HUANG WENQI; KALUM LISBETH; NOVOZYMES AS; OESTERGAARD LARS HENRIK; WANG CHU
WANG CHU; ZHOU YUCHENG; HUANG WENQI; OESTERGAARD LARS HENRIK; KALUM LISBETH
公开日期: 2017-06-06 申请日期: 2012-09-07 公开号: US9670614B2

16. Color modification of textile
Yucheng Zhou; Chu Wang; Lisbeth Kalum; Lars Henrik Oestergaard; Wenqi Huang
Yucheng Zhou; Chu Wang; Lisbeth Kalum; Lars Henrik Oestergaard; Wenqi Huang
公开日期: 2017-06-06 申请日期: 2012-09-07 公开号: US09670614B2

17. Composition useful for color modification e.g. bleaching of textile, preferably denim comprises a peroxidase, a source of hydrogen peroxide, and a mediator.
NOVOZYMES AS
CHU WANG; LARS HENRIK OESTERGAARD; LISBETH KALUM; WENQI HUANG; YUCHENG ZHOU
公开日期: 2017-04-04 申请日期: 2012-09-07 公开号: BR112014006807A2

18. CYSTEINE-REACTIVE LIGAND DISCOVERY IN PROTEOMES
SCRIPPS RESEARCH INST
CRAVATT BENJAMIN; WANG CHU; BACKUS KERIANN
公开日期: 2016-09-01 申请日期: 2014-08-13 公开号: US2016252509A1

19. CYSTEINE-REACTIVE LIGAND DISCOVERY IN PROTEOMES
SCRIPPS RESEARCH INST
CRAVATT BENJAMIN; WANG CHU; BACKUS KERIANN
公开日期: 2016-06-22 申请日期: 2014-08-13 公开号: EP3033625A1

20. COLOR MODIFICATION OF TEXTILE
NOVOZYMES AS
KALUM LISBETH; ZHOU YUCHENG; WANG CHU; ØSTERGAARD LARS HENRIK; HUANG WENQI
公开日期: 2015-07-03 申请日期: 2014-04-16 公开号: IN2910CHN2014A
科研项目:
1. 细胞内丙烯醛修饰靶点的定量化学蛋白质组分析和功能研究
立项时间: 2015-2018 项目经费:950000

2. Quantitative proteomic profiling of reactive cysteines in oxidative stress
立项时间: 2011-2013 项目经费:80811

3. Quantitative proteomic profiling of reactive cysteines in oxidative stress
立项时间: 2011-2013 项目经费:80811

4. 生物正交酶催化探针脱保护进而实现亚细胞选择性的基于活性的标记
立项时间: 2021-2022

5. 蛋白质亲电性修饰捕获探针的开发和应用
立项时间: 2022

6. 探究O-GlcNAcase蛋白在空间分布和时间变化下热稳定性差异
立项时间: 2018

7. 基于硒同位素印记的化学蛋白质组学
立项时间: 2018-2021

8. 细胞铁死亡中新型羰基化修饰的组学发现和修饰率的定量分析
立项时间: 2020-2022

项目合作

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