1.微生物代谢及合成途径的设计：在理解微生物代谢原理与生命规律的基础上，开展新型生物质能源、材料及化学品合成路径的创新设计并通过基因工程、酶工程、分子生物学、合成生物学等多种手段，获得原子得率与能量效率更经济可行的人工细胞；
2.细胞生理研究与应用过程开发：仿自然生态提出具有细胞集群效应、生理分化的工业微生物应用新思路，开展以微生物种群、形态、生长分裂、寿命等为研究对象的新体系，由此开发更高级的微生物发酵工程、蛋白质（药物/材料/酶）制造工程、植物细胞工程等应用新技术。

1.国家自然科学基金委面上项目，谷氨酸棒杆菌生物被膜发酵体系的构建及其生理代谢效应研究与应用，项目主持人
2.江苏省前沿引领技术基础研究专项子课题，特定蛋白质的连续分泌生产技术，子课题主持人
3. JG项目，***酶的改造与性能优化，项目主持人
4.国家重点研发项目子课题，发酵-膜分离一体化工艺的细胞生理代谢研究，子课题主持人
5.国家自然科学青年基金，基于产溶剂梭菌的NAD(P)H补偿模块对中心碳代谢的调控作用研究，项目主持人
6.江苏省自然科学基金，生物丁醇与乙偶姻联产过程的构建及还原力补偿机制的研究，项目主持人
7.企业委托项目，鱼类胶原蛋白，项目主持人8.企业委托项目，酒糟发酵饲料项目主持人