徐自祥 副研究员 博士 天津市 研究领域: 生物医药 研究方向: 将数学方法和计算技术结合应用到生物学领域,以干助湿为生物学实验提供指导 所在单位: 中国科学院天津工业生物技术研究所

基本信息

所在单位:
中国科学院天津工业生物技术研究所
职务:
副研究员
职称:
副研究员
最高学历:
博士
教育经历:
2006年博士毕业于西北工业大学,电子信息学院,系统工程专业。
2001年硕士毕业于江苏大学,理学院,计算力学专业。
1995年本科毕业于合肥师范学院,物理系,物理专业。
工作经历:
2009年起就职于中国科学院天津工业生物技术研究所,助理研究员、副研究员。
2009年博士后出站于东南大学,吴健雄实验室,生物信息学方向。
专家介绍:
徐自祥,研究方向定位于计算生物学,具有交叉学科的知识结构,致力于将数学方法和计算技术结合应用到生物学领域,以干助湿为生物学实验提供指导。总体方向是工业微生物的计算机辅助设计,具体研究方向包括:
1)智能与数值计算方法:计算数学、人工智能、大数据技术等。
2)计算生物学(化学与生物信息学方向):计算蛋白质科学、工业酶设计。
3)计算生物学(系统与合成生物学方向):组学大数据分析、细胞工厂设计。
专家荣誉:
2001年,硕士学位论文“结构拓扑优化研究与应用”获江苏大学优秀硕士学位论文。

科研能力

研究领域:
生物医药
研究方向:
将数学方法和计算技术结合应用到生物学领域,以干助湿为生物学实验提供指导
论文著作:
1. Xu Zixiang, et.al.. In Silico Genome- Scale Reconstruction and Analysis of the Shewanella loihica PV-4 Metabolic Network. Journal of Biological Systems. 2018,
26(3): 373–397
2. Xu Zixiang, et.al.. Find_tfSBP: find thermodynamics feasible and smallest balanced pathways with high yield from large-scale metabolic network. Scientific
Reports. 2017, 7:17334
3. Xu Zixiang, et.al.. ReacKnock: identifying reaction deletion strategies for microbial strain optimization based on genome-scale metabolic network.  PLoS ONE .  2013, 8(12): e72150.
4. Xu Zixiang, et.al.. Reconstruction of whole cell network and design of cell factory.  Progress in Biochemistry and Biophysics.  2014,41(2):105~114.
5.  Xu Zixiang, et.al.. Genome-Scale Analysis to the Impact of Gene deletion on the Metabolism of E. coli: Constraint-Based Simulation Approach. BMC  Bioinformatics. 2009, 10 (Suppl 1): S62.
6. Xu ZiXiang, et.al.. Numerical Method Based On Hamilton System And Symplectic Algorithm To Differential Games. Applied Mathematics And Mechanics (Eng Ed).  2006,27(3):341-346.
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