生物医药

发酵过程优化与放大

1.  Muhammad Mohsin, Rabia Omer Zubair, Jiaofang Huang*, Ali Mohsin, Meijin Guo, Jiangchao Qian, Yingping Zhuang*, Advances in engineered Bacillus subtilis biofilms and spores, and their applications in bioremediation, biocatalysis, and biomaterials.2021, Synthetic & Systems  Biotechnology. 6(3): 180-191, DOI10.1016/j.synbio.2021.07.002 (SEP 2021)
2．Jingru Zhou, Yingping Zhuang*, Jianye Xia*, Integration of enzyme constraints in a genome-scale metabolic model of Aspergillus niger improves phenotype predictions. 2021, Microbial Cell Factories. 20(1):125, DOI10.1186/s12934-021-01614-2（JUN 30 2021）
3．Xiaonuo Teng, Chao Li, Xiaoping Yi*, Yingping Zhuang*, A novel scale-up strategy for cultivation of BHK-21 cells based on similar hydrodynamic environments in the bioreactors.  2021, Bioresources & Bioprocessing. 8(1), DOI10.1186/s40643-021-00393-3, AUG 13 2021
4.  Jianye Xia, Guan Wang, Meng Fan, Min Chen, Zeyu Wang, Yingping Zhuang*, Understanding the scale-up of fermentation processes from the viewpoint of the flow field in bioreactors and the physiological response of strains.2021, Chinese Journal of Chemical Engineering. 30: 178-184.FEB 2021
5. Ali Mohsin, Waqas Qamar Zaman, Meijin Guo*, Waheed Ahmed, Imran Mahmood Khan, Sobia Niazi, Abdur Rehman, Haifeng Hang, Yingping Zhuang*, Xanthan-Curdlan nexus for synthesizing edible food packaging films. International Journal of Biological Macromolecules. 2020, 162:43-49. (2020.11, IF：5.162，Q1)
6.  Yu-fei Sui, Tabea Schuetze, Li-ming Ouyang, Hongzhong Lu, Peng Liu, Xianzun Xiao, Jie Qi, Ying-Ping Zhuang*, Vera Meyer*,  Engineering cofactor metabolism for improved protein and glucoamylase production in Aspergillus niger. Microbial Cell Factories. 2020,19(1),198,DOI: 10.1186/s12934-020-01450-w (2020.10, Q1 ,IF：4.187)
7. Shaohuang Shen, Guan Wang, Ming Zhang, Yin Tang, Yang Gu, Weihong Jiang, Yonghong Wang*, Yingping Zhuang*, Effect of temperature and surfactant on biomass growth and higher-alcohol production during syngas fermentation by Clostridium carboxidivorans P7. Bioresources & Bioprocessing. 2020,7(1),56,DOI: 10.1186/s40643-020-00344-4 (2020.10.22)
8. Ze-Jian Wang, Xingzi Zhang, Ping Wang, Meijin Guo, Siliang Zhang, Yingping Zhuang*, Oxygen Uptake Rate Controlling Strategy Balanced with Oxygen Supply for Improving Coenzyme Q(10)Production byRhodobacter sphaeroides. Biotechnology & Bioprocess Engineering. 2020,25(3): 459-469 (2020.7, Q3,IF:2.213)
9. Hui Ni, Ali Mohsin, Meijin Guo,  Ju Chu, Yingping Zhuang*, Two-component system AfrQ1Q2 involved in oxytetracycline biosynthesis of Streptomyces rimosus M4018 in a medium-dependent manner. Journal of Bioscience & Bioengineering. 2020,129(2): 140-145 (2020.2, Q2, IF:2.366)ngineering. 2020,25(3): 459-469 (2020.7, Q3,IF:2.213)
10.  Yu-Fei Sui#, Li-Ming Ouyang#, Tabea Schuetze, Shu Cheng, Vera Meyer*, Ying-Ping Zhuang*,Comparative genomics of the aconidial Aspergillus niger strain LDM3 predicts genes associated with its high protein secretion capacity. Applied Microbiology & Biotechnology. 2020, DOI: 10.1007/s00253-020-10398-1(Feb.20 20)
11.  Zejian Wang, Jiayun Xue, Huijie Sun, Mingxia Zhao, Yonghong Wang, Ju Chu, Yingping Zhuang*, Evaluation of mixing effect and shear stress of different impeller combinations on nemadectin fermentation. Process Biochemistry. 2020, 92:120-129 (2020.5,Q2,IF:2.952)
12.  Guan Wang, Haringa, C., Wenjun Tang, Henk J. Noorman,, Ju Chu, Yingping Zhuang*, & Siliang Zhang,  Coupled metabolic‐hydrodynamic modeling enabling rational scale‐up of industrial bioprocesses. Biotechnology and Bioengineering, 2020,117(3), 844-867.
13.   Guan Wang, Haringa, C.,Henk J. Noorman,, Ju Chu, Yingping Zhuang*. Developing a Computational Framework To Advance Bioprocess Scale-Up. Trends in Biotechnology. 2020, 38(1), 68-82
14.   Guan Wang, Junfei Zhao, Xinxin Wang, Tong Wang, Yingping Zhuang*, Ju Chu*, Siliang Zhang, Henk J. Noorman, Quantitative metabolomics and metabolic flux analysis reveal impact of altered trehalose metabolism on metabolic phenotypes of Penicillium chrysogenum in aerobic glucose-limited chemostats. Biochemical Engineering Journal.2019,146:41-51 (2019.6) Q2
15.   Guan Wang, Ju Chu, Yingping Zhuang*, A dynamic model-based preparation of uniformly- C-13-labeled internal standards facilitates quantitative metabolomics analysis of Penicillium chrysogenum. Journal of Biotechnology, 2019, 299:21-31(2019.6) Q2
16.   Hui Ni, Ali Mohsin, Meijin Guo*, Ju Chu, Yingping Zhuang*,Two-component system AfrQ1Q2 involved in oxytetracycline biosynthesis of Streptomyces rimosus M4018 in a medium-dependent manner. Journal of Bioscience & Bioengineering,2019,129，(2):140-145(2019.08)
17.   Jia Lin, Xiaoping Yi, Yingping Zhuang*, Medium optimization based on comparative metabolomic analysis of chicken embryo fibroblast DF-1 cells. RSC Advances. 2019, 9(47): 27369-27377 (2019.9) Q2
18.   Guan Wang, Xinxin Wang, Tong Wang, Walter van Gulik, Henk J. Noorman, Yingping Zhuang,* Ju Chu*, Siliang Zhang ,Comparative Fluxome and Metabolome Analysis of Formate as an Auxiliary Substrate for Penicillin Production in Glucose-Limited Cultivation of Penicillium chrysogenum. Biotechnology Journal. 2019, 14(10):1900009 (2019.10) Q1
19.   Qi Zhang, Haifeng Hang, Xiwei Tian, Wei Zeng, Zhenhua Yu, Xiaojian Wang, Yin Tang, Yingping Zhuang*, Ju Chu*, Combined available nitrogen resources enhanced erythromycin production and preliminary exploration of metabolic flux analysis under nitrogen perturbations. Bioprocess & Biosystems Engineering. 2019, 42(11):1747-1756 (2019.11) Q2
20.   Wei Zou, Xiao-Hua Wang, Kui-Pu Zhang, Ali Mohsin, Mei-Jin Guo*, Hua-Mei Liu, Li Zhang, Lan Li, Si-Liang Zhang, Ying-Ping Zhuang*. Study on production enhancement of validamycin A using online capacitance measurement coupled with H-1 NMR spectroscopy analysis in a plant-scale bioreactor. Process Biochemistry. 2018,65:28-36,Sep,2018
21.   Ao Pan, Minghui Xie, Jianye Xia*, Ju Chu, Yingping Zhuang*.Gas-liquid mass transfer studies: The influence of single- and double-impeller configurations in stirred tanks. 2018, Korean Journal of Chemical Engineering.2018,35(1):61-72 .Jan,2018
22.   Ao Pan, Minghui Xie, Chao Li, Jianye Xia*, Ju Chu,  Yingping Zhuang*, CFD Simulation of Average and Local Gas-Liquid Flow Properties in Stirred Tank Reactors with Multiple Rushton Impellers. Journal of Chemical Engineering of Japan.2018, 50(12):878-891
23.   Shaohuang Shen, Yang Gu,Changsheng Chai, Weihong Jiang,Yingping Zhuang*,Yonghong Wang*, Enhanced alcohol titre and ratio in carbon monoxide-rich off-gas fermentation of Clostridium carboxidivorans through combination of trace metals optimization with variable-temperature cultivation, Bioresource Technology. 2017,239:236-243
24.   Yaning Chang, Yuke Peng, Pengfei Li, Yingping Zhuang*, Practices and Exploration on competition of molecular biological detection technology among students in food guality and safety major. Biochemistry & Molecular Biology Education. 2017, 45(4):343-350
25.  Xiangyun Lv, Bo Yu, Xiwei Tian, Yu Chen, Zejian Wang, Yingping Zhuang*, Yonghong Wang*. Effect of pH, glucoamylase, pullulanase and invertase addition on the degradation of residual sugar in L-lactic acid fermentation by Bacillus coagulans HL-5 with corn flour hydrolysate.Journal of the Taiwan Institute of Chemical Engineering. 2016,61:124-131.
26.   Ze-JianWang,WeiZhang, Jian-WenZhang,Mei-Jin Guo, Ying-pingZhuang*,Optimization of a broth conductivity controlling strategy directed by an online viable biomass sensor for enhancing Taxus cell growth rate and Taxol productivity.RSC Advances. 2016, 6(47):40631-40640
27.  Zhongwu Xia,† Xiaoping Yi† and Yingping Zhuang*. Stable over-expression of the human malate-aspartate NADH shuttle member Aralar I in PK15 cells improves energy metabolism and enhances proliferation of porcine circovirus-2. RSC Advances.  2016, 6, 61268–61277
28.  Xiangyun Lv，Jiali Song, Bo Yu, Huilan Liu, Chao Li, Yingping Zhuang*, Yonghong Wang*,High-throughput system for screening of high L-lactic acid-productivity strains in deep-well microtiter plates. 2016, Bioprocess & Biosystems Engineering. 39(11):1737-1747. DOI: 10.1007/s00449-016-1649-y
29.   AoPan, MinghuiXie,JianyeXia*,JuChu,YingpingZhuang*, Gas-liquid mass transfer studies: The influence of single- and double-impeller configurations in stirred tanks. Korean Journal of Chemical Engineering.2016,35(1):61-72
30.  Xiangyun Lv, Yuanxin Guo, Yingping Zhuang*, Yonghong Wang*, Optimization and validation of an extraction method and HPAEC-PAD for determination of residual sugar composition in L-lactic acid industrial fermentation broth with a high salt content. Analytical Methods. 2015, 7(21):9076-9083
31.   Lan Li, Zejian Wang*, Xuejun Chen, Ju Chu, Yingping Zhuang, Siliang Zhang, Optimization of polyhydroxyalkanoates fermentations with on-line capacitance measurement. Bioresource Technology. 2014, 156:216-221.
32.   Wang, Yong, Zhuang, Ying-ping*, Wang, Ping, Chu, Ju, Zhang, Si-liang. Regulation of meilingmycin in Streptomyces nanchangensis: Effect of ammonium ion, Korean Journal of  Chemical Engineering. 2010, 27(3): 910-914
33.   Suwen Hu,  LeiDeng, Huamao Wang, Yingping Zhuang, Ju Chu, Siliang Li, Zhonghai Zhang, Meijin Guo, Bioprocess development for the production of mouse-human chimeric anti-epidermal growth factor receptor vIII antibody C12 by suspension culture of recombinant Chinese hamster ovary cells. Cytotechnology. 2011,63(3):247-258, MAY 2011

1.  一种提高肌苷发酵过程糖苷转化率及产率的方法，发明申请号：200310122798.9，申请日期：2003-12-25,授权号： ZL 2003 1  0122798.9, 授权日期：2006-01-04, 申请人：储炬，陈双喜，张嗣良，庄英萍
2.  一种蚯蚓纤溶酶及其编码序列与用途，发明专利申请号：200510023241.9，申请日期：2005-01-12, 专利授权号ZL 2005 1  0023241.9，授权日：2007-12-19，申请人：储炬，黄文华，秦奕辉，庄英萍，张嗣良
3.  一种制备硫腺苷甲硫氨酸的改进方法，发明专利申请号：200510025183.3，申请日期：2005-04-19, 专利授权号 ZL 2005 1  0025183.3，授权日：2008-1-30，申请人： 张嗣良，储炬，胡晓清，朱志钢，朱闪，庄英萍，王永红
4.  一种重组复合α干扰素的制备方法，专利号申请号：200510028285.0 申请日期：2005-07-29, 专利授权号ZL 2005 1  0028285.0，授权日：2008-3-5，申请人：储炬，郝玉有，张嗣良，庄英萍，史琪琪，王永红，杭海峰，刘志敏
5.  一种新的腺苷甲硫氨酸的体外酶促转化方法, 申请号：200610024158.8, 申请日期：2006-02-27, 专利授权号ZL 2006 1  0024158.8，授权日：2008-1-23，申请人：庄英萍，武鑫，储炬，张嗣良，胡晓清，袁中一
6.  一种S-腺苷甲硫氨酸生产菌株的构建及大规模发酵，申请号：200610117828.0，申请日期：2006-11-1，授权专利号：ZL 2006 1  0117828.0，授权日期：2009-9-9，申请人：储炬，胡辉，王勇，张嗣良，庄英萍
7. 组成型大肠干菌基因工程菌的发酵工艺,  申请号：200610024465.6,申请日期：2006-03-08, 公开号：CN1821386A，申请人：  张嗣良，储炬，苟斌全，庄英萍，黄华，李震，王永红
8.  一种新的发酵生产乳酸的培养基配方，申请号：200610118858.3，申请日期：2006-11-29，公开号：CN1962851A，申请人：庄英萍，邱伙琴，徐国谦，储炬，张嗣良，王永红
9.  一种发酵生产S-腺苷甲硫氨酸的方法，申请号：200710036807.0，申请日期：2007-1-24，公开号CN101012470A，专利号：ZL200710036807.0，申请人：储炬，张卓，张嗣良，庄英萍，王永红，胡晓清，袁中一
10.  重组的降糖肽及其生产菌株的构建和培养方法，申请号：200710037133.6，申请日期：2007-2-5，公开号CN101029081A，申请人：庄英萍，王晖，储炬，张嗣良，钱江潮，王永红
11.  一种制备链霉菌全蛋白的方法，申请号：200710047439.X  ，申请日期：2007-10-26日，公开号：CN101157721A，专利授权号：ZL200710047439.X，申请人：王永红, 银鹏, 张嗣良, 庄英萍,  储炬
12.  利用重组大肠杆菌高效生产丙酮酸氧化酶的培养基，申请号：200710047750.4，申请日期：2007-10-28，公开号：CN101182486A，授权号：200710047750.4，申请人：张嗣良，赵劼，王永红，储炬，庄英萍，袁中一
13.  利用氧化还原电位调控乳酸发酵，申请号200810034199.4，申请日期：2008年3月4日，公开号：CN101235397A，专利号：ZL200810034199.4，授权日：2010年12月8日，申请人：王永红，储炬，郑继岱，徐国谦，庄英萍，张嗣良
14.  基于氧化还原电位自动反馈调控厌氧发酵生产乙醇的方法，申请日期：2008年9月26日，申请号：200810200505.7，公开号：CN101358210A，专利号：ZL200810200505.7，申请人：杭海峰，王永红，王强，储炬，庄英萍，郑超，张嗣良
15.  一种重组人复合α干扰素（cIFN）异构体的分离方法，申请日期：2008年5月16日，申请号：200810037559.6，公开号：CN101580533A，专利号：ZL200810037559.6，申请人：庄英萍，杨琪，郝玉有，储炬，程杰，王维娜，符晓辉，张嗣良
16.  利用铵离子调控林可霉素发酵过程及提高林可霉素产素，申请日期2008年1月23日，申请号：200810032954.5，公开号：CN101220385.A，专利号：ZL200810032954.5，申请人：储炬，李啸，张嗣良，庄英萍，钟承赞，葛友群，杭海峰，王永红，郭美锦，夏建业，章付林，杨明
17.  一种快速酶解混合蛋白质的方法，申请号：200810207956.3，申请日期：2008年12月26日，授权号：ZL200810207956.3，授权日期：2011年11月9日，申请人：李友元，李雅萍，王永红，陈长华，储炬，庄英萍，张嗣良
18.  微孔板固定装置，申请号：200920068480.X，专利号：ZL2009200688480.X，申请日期：2009年3月5日，申请人：郝玉有，储炬，庄英萍，张嗣良（实用新型）
19.  一种微孔板盘，申请号：200920068504.1，专利号：ZL200920068504.1,申请日期：2009年3月6日，申请人：郝玉有，储炬，庄英萍，张嗣良（实用新型）
20.  GAP启动子文库及其用途，申请号：200910053198.8，申请日期：2009年5月17日，公开号：CN101922047A，专利号：ZL200910053198.8，授权日：2012年12月26日，申请人：钱江潮，秦秀林，储炬，庄英萍，张嗣良，肖慈英
21.  基于生物信息的发酵过程工艺分析软件（简称发酵之星），登记号：2009SR027762，编号：软著登字第0154761号，著作权人：华东理工大学
22.  基于生物信息的发酵过程控制软件V1.0，登记号：2009SR027760，编号：软著登字第0154759号，著作权人：华东理工大学
23.  基于振荡-补光策略的新型光合生物制氢工艺，申请号：200910048227.2，公开号：CN101845460A，专利号：ZL  200910048227.2，授权日：2012年，申请日期：2009-3-26，申请人：王永红，张明，李旭，张嗣良，张波，储炬，庄英萍，鲍杰
24. 提高脱氮假单胞杆菌维生素B12产量的方法200810034948.3申请日期：2008-03-21，专利授权号：ZL  200810034948.3，专利授权日：2013-04-17，申请人：张嗣良；赵强；李昆太；刘东洪；庄英萍；储炬；王振国；李永亮
25. 基于氧消耗速率的维生素B12发酵生产控制工艺，专利申请号：200910196035.6，申请日期：2009-09-22，专利授权号：ZL200910196035.6，专利授权日：2013-04-17，申请人：张嗣良；王泽建；王慧媛；储炬；庄英萍
26. 发酵联动装置，申请号：201220588863.1，申请日期：2012年11月9日，专利授权号：ZL201220588863.1，授权日期：2013年5月8日，申请人：王泽建，张明，张剑坤，张嗣良，储炬，庄英萍，郭美锦，黄明志，夏建业，杭海峰（实用新型）
27. 微型全息式生物传感反应器系统，申请号：201010176549.8，申请日期：2010年5月19日，专利授权号：ZL201010176549.8，专利授权日：2013年6月26日，申请人：黄明志，王泽建，张一鸣，陈丽，刘玉伟，储炬，庄英萍，张嗣良
28. 一种可精确定时、定量并在位灭活的全自动快速取样设备，申请号：201310180350.0，申请日期：2013年5月15日，专利授权号：ZL201310180305.0，授权日期：2014年10月12日，申请人：黄明志，李敏超，王泽建，刘玉伟，储炬，庄英萍，张嗣良
29. 基于工业以太网技术的发本地过程数据通信软件，登记号：2013SR20247，授权日：2013年11月06日，开发完成日期：2013年05月27日，著作权人：华东理工大学
30. 一种头孢菌素C的发酵方法，申请号：201210429362.3，专利授权号：ZL201210429362.3，授权日期：2014年10月15日，申请日期：2012年10月31日，申请人：黎亮，张俊波，储炬，李树友，庄英萍，苗瑞春，张嗣良，陆俊
31. 一种提高土霉素产量的方法，申请日期：2012年3月16日，申请号：201210071770.6，授权日期：2015年6月17日，申请人：郭美锦，张嗣良，于岚，顔湘云，王龙，储炬，庄英萍，肖慈英
32. 一种增加龟裂链霉菌的土霉素产量的方法,  申请日期：2011年4月27日,专利申请号：  201110107321.8,授权日：2015年3月4日,完成人：郭美锦;郑子静;姚高峰;储炬;庄英萍;张嗣良;钱江潮
33. 谷氨酸棒状杆菌细胞膜脂肪酸组成的分析方法,  专利申请号：201210044608.5, 申请日期：2012年2月24, 授权日：2015年8月12日,  刘玉伟;康茜;刘剑;赵策;杭海峰;刘云肖;霍秦秦;黄明志;庄英萍;储炬;张嗣良

1.“绿色生物制造”重点研究计划项目：生物反应器与智能生物制造（项目编号：2021YFC2101100），2021.7-2024.6，2408万，项目负责人
2.  自然科学基金项目：流场环境与细胞反应相互感知的产黄青霉“在体”动力学模型的建立与数值模拟研究（21978085），2020-2023，65万元
3.  上海市重点项目：上海生物过程工程服务平台再建设，（项目编号：18DZ2290800），2018-2021，150万
4. 上海市重点项目：上海生物过程工程服务平台再建设，（项目编号：15DZ2290550）；2015-2017，200万
5. 上海市重点项目：上海生物过程工程服务平台再建设，（项目编号：13DZ2290500），2013-2015，200万
6. 上海市重点项目：上海生物过程工程服务平台再建设，（项目编号：11DZ2292700），2011-2013，250万
7. 973课题：工业生物技术的过程科学基础研究--生化反应过程放大原理与方法（项目编号：2007CB714303），2007-2011，450万
8. 国家科技支撑项目课题：抗生素大规模生产关键技术创新--抗生素发酵工艺与装备集成创新研究（项目编号：2007 BAI26B02），2007-2011，150万

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