生物化学工程和环境工程，包括：贵金属纳米颗粒及其催化剂的生物还原制备技术；重金属的生物吸附、高浓度有机废水处理以及固体废弃物的资源化处理技术；微生物培养与工业微生物产品的发酵技术；天然产物中活性物质的分离纯化。

1. “基于生物模板制备集成纳米贵金属催化剂的基础研究”，国家自然科学基金重点项目，2016-2020，350万；
2. “生物甲烷系统中若干过程高效转化的基础研究”（子课题五），国家重点基础研究计划（973计划），2013-2017，428万；
3. “基于红藻kappa-卡拉胶工业废渣绿色利用的海洋卡拉胶酶资源筛选及性能优化”，国家自然科学基金面上项目，2020-2023，62万；
4. “生物还原-离子液体增强负载法制备丙烯环氧化金催化剂的过程原理研究”，国家自然科学基金面上项目，2015-2018，96万；
5. “微生物纳米导线pili在河口沉积物异化铁还原过程中的作用机制”，国家自然科学基金面上项目，2013-2016，90万；
6. “基于微生物非酶还原法的纳米Pd/菌体催化剂的制备过程的基础研究”，高等学校博士学科点专项科研基金，2011-2013，6万；
7. “生物质还原法制备贵金属纳米颗粒及其催化剂的化学与工程基础研究”，国家自然科学基金重点项目，2011-2014，230万；
8. “贵金属纳米颗粒及其催化剂的生物还原制备技术”，国家863计划项目, 2008-2010，96万；
9. “基于微生物还原法的Au/菌体催化剂制备过程的基础研究”，国家自然科学基金面上项目，2010-2012，35万；
10. “植物生物质还原法制备负载型离子液体固定化贵金属催化剂的研究”，国家自然科学基金面上项目，2008-2010，30万；
11. “用于丙烯气相环氧化制环氧丙烷负载型金催化剂的研究开发”，稀贵金属综合利用新技术国家重点实验室开放课题，2012.10-2014.12，28万；
12.“生物还原法制备银纳米线的研究”，国家自然科学基金面上项目，2004-2006，22万；
13.“微生物还原法制备负载型贵金属催化剂的基础研究”，国家自然科学基金面上项目，2006-2008，26万；
14.“厌氧－好氧循环一体化废水生物处理技术的基础研究”，国家自然科学基金面上项目，2001-2003，25万；
15. “雨生红球藻光胁迫生产虾青素的工艺优化及中试放大”，福建省高校产学合作项目， 2015-2018，45万元；
16. “耐污染磁阻垢式双膜海水淡化装置”，福建省海洋高新产业发展专项项目，2014-2017，80万元；
17. “电驱离子膜法制革含铬废水资源化处理技术和装备开发及示范工程”，福建省发改委产业技术联合创新专项项目，2016-2017，200万元；
18. 连续法植物生物质还原制备纳米银的技术开发，福建省科技重点项目，2009-2012，15万；
19. 构建高选择性基因工程菌治理生活污水配伍的重金属废水，教育部优秀青年教师资助计划项目，2003，9万；
20. 低值黄酮生物转化汇流制备新橙皮苷二氢查耳酮的关键技术,厦门市科技项目，2018-2020，50万；
21. “污泥资源化生产可降解塑料聚羟基烷酸PHAs的技术开发”，厦门市科技项目，2007-2010，15万；
22. 连续化生产乙醛酸的清洁工艺开发，福建省科技厅科技计划重点项目，2003，15万；