赵永兵 研究员 博士 广东省 研究领域: 生物医药 研究方向: 1)系统整合多组学大数据,构建细胞表征与状态预测的深度学习模型和算法; 2)建立细胞数字孪生体系,模拟发育与稳态、疾病发生与药物干预过程中的细胞动态与扰动响应; 3)解析转录因子与调控元件间的作用规则,揭示细胞动态演化过程的细胞特异性调控网络及其作用机制。 所在单位: 中国科学院广州生物医药与健康研究院

基本信息

所在单位:
中国科学院广州生物医药与健康研究院
单位类型:
科研机构
职务:
研究员
职称:
研究员
最高学历:
博士
教育经历:
2009年08月 – 2014年07月中国科学院北京基因组研究所/博士
2005年09月 – 2009年06月华中科技大学/学士
工作经历:
2023年10月 – 至今中国科学院广州生物医药与健康研究院 研究员
2017年02月 – 2023年10月美国国立卫生研究院(NIH) / 博士后(Postdoctora·Fellow)、专职研究员(Research Fellow)
2014年10月 – 2017年02月梅奥医学中心(Mayo Clinic)/ 专职研究员(Research Fellow)

科研能力

研究领域:
生物医药
研究方向:
1)系统整合多组学大数据,构建细胞表征与状态预测的深度学习模型和算法;
2)建立细胞数字孪生体系,模拟发育与稳态、疾病发生与药物干预过程中的细胞动态与扰动响应;
3)解析转录因子与调控元件间的作用规则,揭示细胞动态演化过程的细胞特异性调控网络及其作用机制。
论文著作:
1. Yongbing Zhao#*. TFSyntax: a database of transcription factors binding syntax in mammalian genomes. Nucleic Acids Research, 2023
2. Yongbing Zhao#*, Supriya V. Vartak#, Andrea Conte#, Xiang Wang#, David A. Garcia#, Evan Stevens, Seol Kyoung Jung, Kyong-Rim Kieffer-Kwon, Laura Vian, Timothy Stodola, Francisco Moris, Laura Chopp, Silvia Preite, Pamela L. Schwartzberg, Joseph M. Kulinski, Ana Olivera, Christelle Harly, Avinash Bhandoola, Elisabeth F. Heuston, David M. Bodine, Raul Urrutia, Arpita Upadhyaya, Matthew T. Weirauch, Gordon Hager and Rafael Casellas*. "Stripe" transcription factors provide accessibility to co-binding partners in mammalian genomes. Molecular Cell, 2022
3. Yongbing Zhao*, Jinfeng Shao, Yan W Asmann*. Assessment and Optimization of the Interpretability of Machine Learning Models Applied to Transcriptomic Data. Genomics, Proteomics and Bioinformatics, 2022
4. Yongbing Zhao#, Jinyue Wang#, Fang Liang, Yanxia Liu, Qi Wang, Hao Zhang, Meiye Jiang, Zhewen Zhang, Wenming Zhao, Yiming Bao, Zhang Zhang, Jiayan Wu, Yan W Asmann, Rujiao Li, Jingfa Xiao. NucMap: a database of genome-wide nucleosome positioning map across species. Nucleic Acids Research, 2019
5. Gaihua Zhang#, Yongbing Zhao#, Yi Liu#, Lipin Kao, Xiao Wang, Benjamin Skerry, and Zhaoyu Li. FOXA1 Defines Cancer Cell Specificity. Science Advances, 2016
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